但水上飞机的弱点是显著的，由于水上起降要求有劣秀的水密性，水上飞机的构造分质、飞翔阻力偏大，载荷、航程、速度等方面都不及同品级其它普通岸基飞机。做战方面更难以承受的是，水上飞机的船型机腹有滑水用途、不能设置舱门，由此无奈给取机身弹舱；而正在机翼上外挂导弹等刀兵，若停行水上起降，外挂刀兵也会遭到海浪的强力攻击，容易损坏。此外，水上飞机间接取海水接触，正在抗腐化、维护保养方面也要比岸基飞机多破费时间。
